蒺藜苜蓿多聚半乳糖醛酸酶基因家族的全基因组分析

• 作者: 伊霖晟 刘冬雪 张鑫茹 束永俊 杨欢欢 杨爽 王阳 胡龄予
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 蒺藜苜蓿 PG 系统进化分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 31-38
• 页数: 8页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 3171字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/201907005

摘要

多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonases,PGs)是一种果胶水解酶,参与果实成熟、器官脱落、花粉成熟等多个植物发育过程.采用相似性比对和结构域搜索方法,从蒺藜苜蓿基因组中共鉴定出74个MtPG基因.根据系统进化关系将其分为6个亚家族,分别包含9、7、4、11,18和25个MtPG基因家族成员.染色体定位分析发现,MtPG基因在蒺藜苜蓿的8条染色体上呈现不均匀分布,每条染色体上分布有2-16个MtPG基因;同时,基因组复制分析结果显示,蒺藜苜蓿的PG基因家族成员之间存在大量的基因复制.最后,通过蒺藜苜蓿的高通量测序数据分析发现,MtPG基因家族广泛地在根部、结瘤、叶片、芽,心皮和花等组织中表达.根据它们在不同组织中表达水平,将31个MtPG基因聚类为4组,分别探讨了四组基因在蒺藜苜蓿组织器官分化中表达模式,重点解析了它们在花器官发育以及根部组织分化中可能的调控机制,这将为进一步研究蒺藜苜蓿MtPG基因家族成员的基因功能提供了理论基础.