欧李叶片全长cDNA文库的构建和部分克隆的序列分析

• 作者: 岳鹏 李天红 李芳 高小丽
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 欧李 全长cDNA文库 ESTs
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 研究资源
• 页码范围: 156-162
• 页数: 7页
• 字数: 4707字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.01.024

摘要

采用SMART技术,构建了欧李(Prunus humilis Bunge)品系T8-1叶片全长cDNA文库,原始文库滴度达6.17×10~7 pfu/mL,库容达3.7×10~7,重组率达95%,平均插入片段大小约为1.2 kb.随机挑取400个单克隆进行5'端测序,共获得364个欧李ESTs.绝大部分ESTs的长度在500～1300 bp之间,平均长度为877 bp,其中具有完整ORF结构的序列有221条,占60.71%.通过与NCBI等非冗余核酸数据库和蛋白质数据库进行比对、查询和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因181个(339个ESTs),相似性较低的未鉴定基因5个(9个ESTs),新基因14个(16个ESTs).