基于线粒体Cytb和ITS1部分序列分析鲭科鱼类分子系统进化关系

• 作者: 傅蒙娜 王军 苏永全 邱凡
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲭科 细胞色素b 转录间隔区1 分子系统树 鱼类进化
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 201-211
• 页数: 11页
• 分类号: S959
• 字数: 6088字
• 语种: 中文

摘要

鲭科(Scombridae)由15属51种表层洄游性海洋鱼类组成,广泛分布于热带和亚热带海域,是重要的经济鱼类.目前关于鲭科鱼类系统发生学的研究主要基于形态学特征.为了从分子水平上阐明鲭科鱼类的分类与系统进化关系,本研究扩增了鲭科7种鱼类的线粒体细胞色素b(Cyt b)基因1个含311个碱基的序列区和转录间隔区1(ITS 1)的1个含644～692个碱基的序列区.采用多个生物软件对序列碱基组成进行分析,计算了Kimura-2 parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数.Cyt b和ITS1序列4种碱基平均含量分别是:A为22.8%、G为16.4%、C为31.2%、T为29.5%和A为13.5%、G为31.3%、C为38.7%、T为16.5%.基于Cyt b计算的鲭科鱼类种间遗传距离为0.006 5～0.333 5,平均遗传距离为0.168 9;基于ITS1计算的金枪鱼族鱼类种间遗传距离为0.003 2～0.266 8,平均遗传距离为0.202 5.Cyt b和ITS1序列的转换/颠换比分别为1.8和0.9.以竹荚鱼(Trachurus trachurus)和花鲈(Lateolabrax japonicus)为外群,并结合GenBank上鲭科24种鱼类的同源序列,构建NJ、ML和ME系统树.研究结果确认了金枪鱼属处于系统进化树的顶端,代表着最新演化的种类,是鲭科中最繁盛的一属,也是目前系统发育的高峰.所有分子系统树都表明鲣属、鲔属和舵鲣属显示与金枪鱼属很近的亲缘关系,它们均归入金枪鱼族.然而,研究结果与形态学上将金枪鱼属分为2个亚属的分类结果存在分歧.同时,本研究关于狐鲣属、平鲣属、刺鲅属和双线鲅属进化地位上的结果也不同于形态学的结果.故鲭科鱼类客观、科学的分类地位还需通过形态学、生态学和分子生物学的深入研究加以确认.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王军	厦门大学海洋与环境学院	144	2234	25.0	39.0
2	苏永全	厦门大学海洋与环境学院	145	2696	29.0	44.0
3	邱凡	厦门大学海洋与环境学院	2	16	2.0	2.0
4	傅蒙娜	厦门大学海洋与环境学院	4	29	4.0	4.0