基孔肯雅病毒WJ0601株基因组全序列测定及分析

• 作者: 余蓉 司炳银 张雨 祝庆余 谭刚
• 来源期刊: 军事医学科学院院刊
• 学科: 医学
• 关键词: 基孔肯雅病毒 基因组 逆转录聚合酶链反应 ESCA
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 153-155
• 分类号: R373.9
• 字数: 1958字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2010.02.014

摘要

目的 对保存的基孔肯雅病毒WJ0601株基因组序列进行测定,并阐明该病毒与已报道毒株序列的关系.方法 对基孔肯雅病毒基因组编码区分14段进行RT-PCR扩增,对非编码区采用RACE法进行扩增,将扩增产物直接进行测序,应用DNAStar软件将测序结果拼接得到基因组序列.结果 与结论基孔肯雅病毒WJ0601株基因组核苷酸共11 826 nt,编码3722个氨基酸,其中5′端的2/3基因组编码4种非结构蛋白nsP1、nsP2、nsP3和nsP4;3′端的1/3基因组编码5种结构蛋白C、E3、E2、6K和E1蛋白.结构基因和非结构基因之间有68 nt的连接区为非翻译区.病毒基因组5′端和3′端分别有76 nt、526 nt的非编码区.序列同源性分析结果表明,此株病毒与S27-African株的同源性最高,两者核苷酸序列同源性为99.9%,氨基酸序列同源性为99.8%,同属于(ESCA)基因型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余蓉	四川大学华西药学院	139	479	11.0	15.0
2	祝庆余	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	50	296	10.0	14.0
3	司炳银	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	19	108	6.0	9.0
4	张雨	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	8	29	3.0	5.0
5	谭刚	四川大学华西药学院	1	1	1.0	1.0