草莓多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)的克隆及组织特异性表达

• 作者: 侯艳霞 张勇 张杰 汤浩茹 罗娅 蒋豪
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 基因克隆 蛋白质结构 组织表达
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 424-430
• 分类号: S6
• 字数: 4977字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.03.003

摘要

以草莓(Fragaria×ananassa)叶片为试材,采用PCR技术,克隆到1条多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,命名为FaPGIP.基因组DNA片段包含一个长为168 bp的内含子;cDNA编码区全长999 bp,编码332个氨基酸残基.预测该蛋白质分子量为37.1 kD,等电点为7.67,N端24个氨基酸残基构成的疏水区域为信号肽,具有5个潜在的N-糖基化位点.序列同源比对结果表明,所克隆的FaPGIP基因与GenBank中登录的蔷薇科及其它物种PGIP基因具有较高的同源性.采用SyPred3D软件预测了该基因所编码的蛋白质的三维结构,表明FaPGIP蛋白质的三维模型类似马蹄的结构,含12段α-螺旋和21段β-折叠,中心LRR结构域由10个串联的LRRs基序组成.半定量RT-PCR分析显示,FaPGIP在草莓根、茎、叶、花和果五种组织中均有表达,其表达量为果>叶>花>根>茎,相对表达量分别为0.246 0、0.166 4、1.371 2、0.872 1和3.415 4.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗娅	四川农业大学园艺学院	50	800	13.0	28.0
2	汤浩茹	四川农业大学园艺学院	150	2302	23.0	42.0
3	张勇	四川农业大学园艺学院	50	712	12.0	26.0
4	侯艳霞	四川农业大学园艺学院	7	187	5.0	7.0
5	蒋豪	四川农业大学园艺学院	4	89	4.0	4.0
6	张杰	四川农业大学园艺学院	8	28	3.0	5.0