A20基因5'上游序列生物信息学分析

• 作者: 吴丽娟 陈潇
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 锌指 蛋白 基因 转录因子 NF-κB 计算生物学
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 1059-1061
• 分类号: Q786|Q591.2
• 字数: 2503字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2010.10.002

摘要

目的 A20是一种胞浆瞬时表达蛋白,通过特定的信号通路负反馈调节体内炎症反应.为了解A20基因表达调控炎症的特点,对其5'上游序列进行生物信息学分析,获取基因调控的相关因素.方法 从Genebank获取A20基因及其上游序列,利用promter 2.0、Transfac 6.0、motif等生物信息学软件分析核转录因子的调控信息.结果 结合多种软件分析,A20基因5'上游序列无典型的TATA盒和CAAT盒,且含有多个高度保守的核转录因子结合位点,包括3个与NF-kappa B结合的区域、4个与AP-1结合的区域、1个与HSF结合的位点、1个与Oct-1结合的位点等.结论 A20的表达调控受包括炎症重要核转录因子在内的多种核转录因子的共同调节,且核转录因子之间的协同作用不可忽视.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴丽娟	成都军区总医院检验科	42	232	9.0	12.0
2	陈潇	成都军区总医院检验科	6	33	4.0	5.0