氨基酸序列特征提取方法研究

• 作者: 罗林波 陈绮
• 来源期刊: 计算机技术与发展
• 学科: 工学
• 关键词: 特征提取 熵密度 完全信息集
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 应用开发研究
• 页码范围: 206-208,212
• 页数: 4页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 2609字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-629X.2010.02.054

摘要

组成蛋白质的基本单位是氨基酸,对于蛋白质分类预测问题,氨基酸序列特征提取方法是一个非常重要的因素.对基于氨基酸组成、位置的特征提取算法如熵密度、n阶耦联组成和基于氨基酸性质的特征提取方法如自相关函数、伪氨基酸组成等方法进行了阐述,并进行了简单评价.基于氨基酸组成的方法实现简单、计算量小,且对所有的氨基酸序列都适用,但丢失了氨基酸的顺序信息以及其间的相互作用,基于氨基酸位置信息或理化特性等方法计算量非常大,科研工作者可以根据对蛋白质的不同要求选择相应的特征提取方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈绮	海南大学信息科学技术学院	11	93	3.0	9.0
2	罗林波	海南大学信息科学技术学院	3	59	2.0	3.0