12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析

• 作者: 崔亚茹 张坤山 李思光 罗玉萍
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因簇 miR-302 分子进化
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 数据分析
• 页码范围: 379-384
• 分类号: Q78
• 语种: 中文

摘要

很多microRNA（miRNA）基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇。miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义。miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用。本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物种的miR-302基因簇。生物信息学分析表明,这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子区,但转录方向与LARP7基因转录方向相反。序列相似性分析显示,同一物种miR-302簇成员间以及不同物种相应miR-302簇成员间相似性均较高。进化分析表明,基因复制可能是miR-302基因簇进化的主要驱动力。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗玉萍	南昌大学生命科学与食品工程学院	55	847	15.0	28.0
2	崔亚茹	南昌大学生命科学与食品工程学院	4	14	3.0	3.0
3	张坤山	同济大学医学院	2	9	2.0	2.0
4	李思光		1	3	1.0	1.0