miR-430基因簇的生物信息学分析

• 作者: 吴建盛 李小慧 汤丽华 王凯
• 来源期刊: 南京邮电大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: mir-430 基因簇 生物信息学预测 分子进化
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 基础科学
• 页码范围: 122-126,132
• 页数: 6页
• 分类号: Q349+.5|Q75
• 字数: 3597字
• 语种: 中文

摘要

很多microRNA (miRNA)基因在基因组上紧密排列形成miRNA基因簇,mir-430是目前已发现的最大miR-NA基因簇,但其起源和进化方面却是未知的.为了揭示mir-430基因簇的起源及其在相关物种的进化关系,文中基于miRNA序列同源保守的特点,采用BLAST程序在NCBI基因数据库中搜索mir-430序列,在14个物种中共搜索到35个mir-430基因序列,这14个物种都为硬骨鱼类.多序列对比发现mir-430基因簇成熟序列的第2到第8位碱基以及第16到第22位碱基为保守序列.进化分析表明七鳃鳗的pma-mir-430基因可能是此基因家族最早出现的基因形式,并且pma-mir-430e可能是其他物种mir-430基因的祖先基因.祖先基因经过个别碱基的缺失及突变、串联重复和大片段重复等方式形成了mir-430基因簇.该研究通过分析不同物种中mir-430基因簇的特征,揭示mir-430基因簇的分子进化规律,为其调控网络和功能研究提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴建盛	南京邮电大学地理与生物信息学院	14	54	4.0	6.0
2	汤丽华	南京邮电大学地理与生物信息学院	10	36	4.0	5.0
3	王凯	南京邮电大学地理与生物信息学院	25	59	3.0	7.0
4	李小慧	南京邮电大学地理与生物信息学院	5	10	2.0	3.0