一株肠道病毒71型广西分离株全基因序列分析

• 作者: 周开娇 居昱 康宁 莫兆军 谢镇国 谭毅 闭福银 陈敏玫
• 来源期刊: 应用预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒 EV71 全基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 272-276
• 分类号: R373.2
• 字数: 2419字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-758X.2011.05.005

摘要

目的 了解肠道病毒71型CZ01株的全基因组分子特征.方法 应用覆盖病毒全基因组的15对特异性引物对毒株进行RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,拼接后得到全基因序列,应用Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析.结果 CZ01株病毒全基因组核苷酸序列长度为7 406bp,与中国大陆北京毒株BJ08-Z011-4和安徽阜阳毒株Fuyang.Anhui/17.08/2整个基因组核苷酸同源性为98.8％和98.5％,氨基酸同源性分别为99.7％和99.6％；与EV71国际标准株MS/7423/87和BrCr基因组核苷酸同源性仅为81.7％和80.0％,氨基酸同源性为95.6％和94.9％.对外壳蛋白VP1编码区进行种系发生分析显示CZ01株为C4亚型的毒株.结论 EV71型病毒CZ01株全基因组的组成和结构符合肠道病毒特征,与其它EV71型病毒具有相同的基因组结构,CZ01株是EV71型的C4亚型的毒株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闭福银		53	383	11.0	16.0
2	莫兆军		46	574	12.0	22.0
3	谢镇国		16	95	5.0	9.0
4	陈敏玫		38	292	10.0	15.0
5	周开娇		2	14	1.0	2.0
6	康宁		21	135	8.0	10.0
7	居昱		18	235	9.0	15.0