西农萨能羊47kD尾部相互作用蛋白基因(TIP47)的cDNA克隆、序列结构分析与组织表达

• 作者: 孙雨婷 李君 王紫骞 罗军 赵旺生 郝娟 钟瑜
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西农萨能羊 47 kD尾部相互作用蛋白(TIP47) 脂滴形成 基因克隆 序列结构分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 864-872
• 分类号: S827
• 字数: 7563字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2011.05.012

摘要

47 kD尾部相互作用蛋白基因(tail-interacting protein 47,TIP47)是影响脂滴形成和代谢的重要基因.本实验以两农萨能羊(Capra hircus)的乳腺组织为研究材料,采用RT-PCR和RACE,克隆了山羊TIP47基因的cDNA全长序列.结果得到TIP47基因cDNA序列全长1 906 bp(GenBank收录号为:HQ846827),包括5＇UTR 82 bp,完整编码区1 314 bp及3＇UTR 510 bp,编码蛋白质的氨基酸数为437,分子量47.36 kD,等电点(pI) 5.14.对TIP47基因的核苷酸和氨基酸序列分析发现,山羊的TIP47与GenBank中牛(Bos taurus)、人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)和猪(Sus scrofa)的TIP47相似性较高.蛋白质结构分析显示,TIP47不存在信号肽序列和跨膜结构；疏水性分析发现,其N端疏水性较强,中间靠近C端部分亲水性较强；三级结构分析发现,其C端呈大写的L形；该基因的遗传距离分析发现,山羊与牛的亲缘关系最近,其次是猪和人.通过RT-qPCR技术对TIP47基因进行了组织表达分析,发现所检测的12个组织中均有TIP47 mRNA的表达,其中乳腺组织中表达最丰富,且远远高于其它组织,脾脏、肺脏次之,肌肉相对最少.研究结果提示,TIP47基因可能在乳腺组织中对脂滴的形成代谢过程有重要作用.