奥利亚罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析

• 作者: 张明 朱佳杰 林勇 甘西 罗永巨 蒋宗良 黎明星
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 奥利亚罗非鱼 线粒体基因组 序列分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 790-800
• 分类号: Q959
• 字数: 5406字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.00790

摘要

采用LA-PCR(long amplification polymerase chain reaction)扩增方法获得奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)线粒体基因组全序列.分析表明,序列全长16 632 bp,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个长度为931 bp的主非编码区.A、T、G、C碱基的组成分别为27.89％、25.50％、15.62％、30.99％.基因排列与罗非鱼属的其他物种一致.13个蛋白质基因除COX1用TGT做起始密码子外,其他均以ATG为起始,终止密码子除COX2、Cyt b、ND4为不完整的T,其余基因均以典型的TAA做终止密码子.22个tRNA的二级结构都具有典型三叶草结构.系统发育分析显示,罗非鱼属与丽鱼科(Cichlidae)其他物种分开,聚为单系群,其中奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼亲缘关系较近,莫桑比克非鱼和罗非鱼KM-2006亲缘关系较近.本研究旨在为进一步利用线粒体基因组分析罗非鱼群体遗传多样性、亲缘关系以及丽鱼科系统进化提供基础依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林勇		36	214	8.0	13.0
2	甘西		52	550	13.0	22.0
3	张明	广西大学动物繁殖研究所	59	209	6.0	12.0
4	罗永巨		55	640	14.0	24.0
5	朱佳杰		7	46	4.0	6.0
6	蒋宗良		4	22	2.0	4.0
8	黎明星	广西大学动物繁殖研究所	3	10	2.0	3.0