HLA-A*02:251新等位基因克隆测序鉴定及序列分析

• 作者: 邓志辉 邹红岩 金士正 高素青
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人类白细胞抗原 等位基因 外显子
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 临床遗传学论著
• 页码范围: 300-303
• 分类号: R551.3
• 字数: 2760字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2011.03.014

摘要

目的 鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)A*02:251新等位基因,分析新等位基因遗传特征.方法 采用聚合酶链反应-测序分型法(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对组织配型健康供、患者进行HLA基因分型,发现先证者核苷酸杂合序列与已知序列不匹配,不能指定先证者HLA等位基因型,对先证者DNA扩增HLA-A位点第2～4外显子,PCR产物经克隆到PMD18-T质粒载体中以获得单链核苷酸序列,对克隆所得产物进行HLA-A基因的第2～4外显子双向测序分析.结果 发现先证者的一个HLA-A*02:06:01基因被确认,而另一个HLA-A基因为新等位基因,其序列被GenBank接受(编号为HM245348).新等位基因序列通过IMGT/HLA 数据库BLAST,与最相近的A*02:01:01:01相比,在第3外显子上有1个核苷酸的不同,即第383位 G>C,密码子 128 GAG→GAC,氨基酸由谷氨酸(Glu)→天门冬氨酸(Asp).供、患者HLA-A、B、C、DQB1位点等位基因不匹配.结论 该等位基因为新的HLA-A*02:251等位基因.中国人群HLA-A 位点第3外显子核苷酸序列存在多态性.