利用全基因组高通量SNP标记定位二花脸×沙子岭家系中的断奶体重QTL

• 作者: 任军 何余湧 张志燕 李完波 杨明 杨杰 欧阳婧 肖石军
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 断奶体重 QTL定位 候选基因 全基因组连锁分析
• 年，卷（期）: 2011,（22）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 4694-4699
• 分类号: S828
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.22.017

摘要

[目的]利用二花脸×沙子岭家系定位影响仔猪45日龄断奶体重的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)并搜寻QTL区间内与表型相关的位置候选基因,为最终鉴别因果基因奠定前期工作基础.[方法]构建二花脸×沙子岭猪F2资源家系,利用Illumina porcine 60k DNA芯片判定F2个体的基因型,对45日龄断奶体重表型进行全基因组连锁分析,定位影响二花脸×沙子岭家系F2家系仔猪45日龄断奶体重的QTL.在Ensemble(EMBL-EBI)和NCBI (National Center for Biotechnology Information)网站基因组数据库中搜寻相应的位置候选基因.[结果]在猪的2号染色体(sus scrofa chromosome 2,SSC2)上定位到了1个5％基因组水平显著的QTL,在猪的5号染色体(sus scrofa chromosome 5,SSC5)和猪的14号染色体(sus scrofa chromosome 14,SSC14)上分别定位到了1个1％基因组水平显著的QTL.在上述3个QTL区域内搜寻到了5个与仔猪45日龄断奶体重相关的候选基因,分别是SSC2上的CYP2R1、COPB1、PDE3B基因和SSC5上的NOP2、GDF3基因.[结论]本研究将影响二花脸×沙子岭家系仔猪45日龄断奶体重的QTL定位于SSC2、SSC5和SSC14,并揭示出5个与仔猪45日龄断奶体重相关的候选基因.