WJBC株盖塔病毒基因组序列测定及与其他甲病毒的系统进化关系

• 作者: 刘伯华 司炳银 常国辉 张雨 杨银辉 祝庆余
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 农学
• 关键词: 盖塔病毒 基因组 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 892-895
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 2081字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2011.12.004

摘要

目的 对WJBC株盖塔病毒(GETV)进行基因组序列测定,阐明其与已报道的GETV及其他甲病毒的关系.方法 将GETV基因组编码区分12段分别进行RT-PCR扩增,将扩增产物直接进行测序,非编码区采用RACE法进行扩增,扩增产物纯化后连入pGEM-T easy载体,经转化DH5α感受态细胞,挑取阳性克隆鉴定后测序,应用DNAStar软件将测序结果拼接获得基因组序列.结果 与结论 GETV基因组核苷酸共11 696 nt,编码3721个氨基酸,非结构基因编码2468个氨基酸,结构基因编码1253个氨基酸,结构基因和非结构基因之间有44 nt的连接区为非翻译区.病毒基因组5′端和3′端分别有78、411 nt的非编码区.序列同源性分析结果表明,此株病毒与M1株盖塔病毒同源性最高,两者核苷酸序列同源性为99.8%,氨基酸序列同源性为99.2%.