河流沉积物中微生物DNA的提取方法比较研究

• 作者: 周岳溪 张乐 张召耀 朱灵峰 王业耀 王海燕 雷书凤
• 来源期刊: 环境工程学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 河流沉积物 微生物 DNA 提取方法
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 环境生物技术
• 页码范围: 935-938
• 分类号: X172
• 语种: 中文

摘要

提取河流沉积物中DNA是研究河流沉积物微生物多样性的难点之一,实验开发了一种酚与SDS的DNA提取方法,与OMEGA和BioDee 2种DNA提取试剂盒方法进行了比较,并通过DNA纯度、PCR扩增结合16S rDNA克隆文库检验对几种方法进行了评价.结果表明,OMEGA DNA提取试剂盒法方法简单,提取的DNA纯度较高,酚+SDS法用时较长,DNA提取量大,纯度较低.BioDee试剂盒提取量最小,虽然对PCR结果没有影响,但不能满足沉积物微生物多样性分析的要求.OMEGA DNA提取试剂盒法和酚+SDS法可分别用于PCR扩增、克隆文库、DGGE等的后续实验.