不同昆虫泛素延伸蛋白基因的生物信息学分析

• 作者: 于玲雅 凤舞剑 强承魁 王胜永 秦越华
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 泛素延伸蛋白 甜菜夜蛾 菜粉蝶 烟夜蛾 黑腹果蝇 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 92-95
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3126字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2011.03.025

摘要

采用生物信息学方法系统分析了甜菜夜蛾、菜粉蝶、烟夜蛾和黑腹果蝇泛素延伸蛋白(UBE)基因序列的遗传多样性、分子进化及其编码氨基酸序列的结构功能域和基序特点.结果显示,4种昆虫UBE基因序列的同源性较高(81.8%～99.7%),且遗传距离较近(0.003～0.199),均编码ubiquitin/L40 UBE.共检出81个多态位点,生成4个单倍型,单倍型多样性(Hd=1.000)、平均核苷酸差异数(K=45.883)、核苷酸多样性(Pi=0.11297),同义替换核苷酸多样性均值(Pi(s)=0.41501)、非同义替换核苷酸多样性均值(Pi(a)=0.02489)、密码子有效值(ENC=38.070～53.458＜61)、偏爱指标(CBI=0.437～0.729＞0)和x2检验计算值(x2=0.454～0.960)表明这4种昆虫UBE基因的遗传多样性较丰富且呈现较强的密码予偏爱性.4条氨基酸序列均含泛素同系物结构域和Ribosomal/L 40结构域各1个,未见信号肽和跨膜结构域;共含14条基序,其中Se-UBE和Dm-UBE基因编码的氨基酸序列各具1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和2个蛋白激酶C磷酸化位点,Pr-UBE和Ha-UBE基因编码的序列则各含2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和2个蛋白激酶C磷酸化位点.研究结果为进一步开展UBE基因分子进化机制、表达特性及昆虫病毒侵染关系等方面的研究提供基础信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	强承魁	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	45	49	4.0	5.0
2	凤舞剑	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	87	133	6.0	8.0
3	王胜永	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	21	35	4.0	5.0
4	秦越华	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	26	33	3.0	4.0
5	于玲雅		9	19	3.0	4.0