山核桃SSR标记的初步开发

• 作者: 吴智敏 宋双 曾燕如 董雷鸣 黄有军 黄银芝
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 经济林学 EST-SSR 山核桃 cDNA文库
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 626-633
• 分类号: S664.1|S718.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0756.2012.04.023

摘要

基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物；建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验.结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8％.将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点.结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的.