核桃EST-SSR标记的开发

• 作者: 冷平 吴春林 王克建 王维霞 郝艳宾 齐建勋
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 核桃 核桃楸 黑核桃 EST SSR标记
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 872-876
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 3069字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.05.022

摘要

从GenBank数据库上公布的5 025条核桃(Juglans regia)EST序列中,用SSRHunter软件搜索到485条EST序列中含有540个SSR,SSR出现频率为10.75%,SSR-ESTs检出率为9.7%.利用检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物43对,对6个核桃样品、1个黑核桃(J.nigra)样品和1个核桃楸(J.mandshurica)样品进行了PCR扩增,其中40对引物有扩增带,占设计引物的93%,35对引物有多态性,占可扩增引物的87.5%.在有多态性的35对引物中,27对引物在核桃种内有多态性;8对引物在核桃种内无多态性,而在核桃、核桃楸和黑核桃种间有多态性.应用UPGMA方法对检测样品进行聚类分析,结果与传统分类一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝艳宾	北京农林科学院林业果树研究所	7	199	7.0	7.0
2	王克建	北京农林科学院林业果树研究所	6	165	6.0	6.0
3	齐建勋	中国农业大学农学与生物技术学院	7	199	7.0	7.0
5	冷平	中国农业大学农学与生物技术学院	56	929	20.0	28.0
8	吴春林	北京农林科学院林业果树研究所	1	28	1.0	1.0
9	王维霞	北京农林科学院林业果树研究所	1	28	1.0	1.0