基于信息熵和残基电荷性的酪氨酸硝基化位点预测

• 作者: 揭志勇 施绍萍 邱建丁
• 来源期刊: 南昌大学学报（理科版）
• 学科: 工学
• 关键词: 酪氨酸硝基化 信息熵 残基电荷性
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 页码范围: 245-249
• 分类号: Q811|TP391
• 字数: 4375字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-0464.2012.03.008

摘要

采用氨基酸残基信息熵优化窗口,结合氨基酸的电荷性构建了蛋白质酪氨酸硝基化位点的预测模型.基于10-倍交叉验证,该模型的预测准确率和马氏相关系数分别达到了84.80％和69.69％.同时,对信息熵优化窗口和传统连续窗口进行了探讨,结果表明,信息熵窗口能够有效捕获酪氨酸硝基化肽段上的重要位点,克服短肽序列易丢失信息而单纯增大肽段长度又会引入冗余信息的矛盾,并最终提高模型的预测性能.特征分析揭示酪氨酸残基的局部静电环境、邻近的进化保守位点和长程位点对酪氨酸硝基化均有重要影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施绍萍	南昌大学化学系	16	68	3.0	8.0
5	揭志勇	南昌陆军学院科文教研室	8	5	2.0	2.0
6	邱建丁	南昌大学化学系	28	66	4.0	7.0