拟南芥GHMP基因家族成员的组织表达及生物信息学分析

• 作者: 叶佳卓 常洪平 李秀山 王育 胡帅 胡怀斌 袁聪颖 郭新红
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 GHMP基因家族成员 组织表达 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 346-351
• 分类号: Q786
• 字数: 2903字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2012.04.011

摘要

利用生物信息学方法获得拟南芥全基因组中12个GHMP基因家族成员.通过实时定量PCR技术研究这12个基因在不同组织中的表达,结果显示它们具有组织表达特异性.构建了拟南芥中GHMP基因家族成员的系统进化树.启动子区调控元件分析表明,大多数GHMP成员包含有光响应、生物钟及其它逆境胁迫响应的相关元件,预测这些GHMP基因家族成员可能参与了植物的光信号、生物钟及相关的逆境胁迫信号转导途径.