从病毒性脑炎患者标本分离的基因Ⅰ型乙脑病毒全基因组序列特征研究

• 作者: 付士红 刘纯婷 叶旭芳 朱武洋 李佳 梁国栋 王兰 王力华 王环宇 赵苏晔 高晓艳
• 来源期刊: 中华实验和临床病毒学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 脑炎病毒,日本 基因型 脑脊髓液 序列分析 种系发生
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 84-86
• 分类号: R373
• 字数: 2355字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2012.02.002

摘要

目的 通过现代分子生物学理论与技术测定和分析了从脑炎患者脑脊液标本分离的基因Ⅰ型乙脑病毒(GZ56株)全基因组序列特征,以了解其致病性的分子基础.方法 采用RT-PCR法和核酸序列测定法获得病毒基因组全序列,并利用DNASTAR、ClustalX version 2.0.9及MEGAversion 4.1等生物学软件分析该乙型脑炎病毒核苷酸序列、氨基酸序列及系统进化等.结果 研究结果表明从病毒性脑炎患者脑脊液标本分离的基因Ⅰ型乙脑病毒(GZ56株)基因组全长为10965nt,编码3432个氨基酸.病毒全基因组分子进化分析显示GZ56株全基因组与国际上第一株从蚊虫分离的基因Ⅰ型乙脑病毒(M-28株)处于同一进化分支.GZ56株与其他基因Ⅰ型乙脑病毒核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.2％～98.6％和98.2％～99.7％.病毒E基因与乙脑病毒灭活疫苗株P3相比存在11个氨基酸差异位点,而与乙脑病毒减毒活疫苗株SA14-14-2相比,在E蛋白上存在14个氨基酸差异位点.结论 本研究提示,从病毒性脑炎患者标本分离的基因Ⅰ型乙脑病毒全基因组未见明显变化,从基因组水平可以推测该病毒可以被现行的乙脑疫苗所保护.