大规模并行基因组测序技术应用于无创产前诊断染色体非整倍体的研究

• 作者: 任景慧 何薇 姚秋璇 张红云 李启运 李玉芝 林琳华 王威 袁红 郭辉
• 来源期刊: 华中科技大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 唐氏综合征 大规模并行基因组测序技术 染色体 无创产前诊断
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 475-480
• 分类号: R714.55
• 字数: 5540字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-0741.2012.04.021

摘要

目的 利用大规模并行基因组测序技术检测孕妇外周血浆中的游离DNA,行胎儿染色体非整倍体的无创产前诊断.方法 选择2009年1月到2010年7月在深圳市人民医院产前诊断中心就诊,孕龄在8~30周之间高龄妊娠、唐氏综合征生化筛查高风险和(或)彩超显示胎儿异常等同意介入产前诊断的孕妇941例,抽取孕妇外周静脉血,提取血浆DNA,制备测序文库,应用Illumina HiSeq2000高通量基因测序仪检测,测得的基因序列与人类的参考基因组比对并作统计分析.同时采集胎儿羊水或脐血,经细胞培养后行羊水或脐血细胞染色体核型分析确定染色体非整倍体.结果①941例孕妇血浆样本处理后经大规模并行基因组测序技术检测判定胎儿为唐氏综合征高风险共27例,非唐氏综合征914例;以羊水或脐血染色体核型分析的结果为金标准进行结果对照,检测出的27例唐氏综合征高风险中2例误诊,其中一例核型为47,XXY,一例核型分析正常.经统计分析胎儿唐氏综合征的检出率为100%,检出正确率99.78%,误诊率0.22%;②941例样本中,检出18-三体高风险14例,18-三体低风险927例.与染色体核型分析相比,统计分析显示无创产前基因检测18-三体胎儿的检出率为93.33%(14/15),漏诊率为 6.67%(1/15)、误诊率为 0.结论 利用大规模并行基因组测序技术检测孕妇外周血浆中的游离DNA行无创产前诊断胎儿染色体非整倍体,其敏感性、特异性与染色体核型分析技术具有较高的一致性.该技术具有无创性、高准确性、高通量等优势,具有临床实际应用价值.