龙眼TIR1和ABP1基因的克隆及其在体胚发生过程中的表达分析

• 作者: 李惠华 林玉玲 苏明华 赖钟雄
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 胚性愈伤组织 生长素受体基因 生长素结合蛋白基因 克隆 序列分析 实时荧光定量PCR法
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 253-264
• 分类号: S667.2
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR结合RACE法,分离克隆龙眼（Dimocarpus longan Lour.）胚性愈伤组织生长素受体基因TIR1（Transport inhibitor response 1,即DL-TIR1）和生长素结合蛋白基因ABP1（Auxin biding protein 1,即DL-ABP1）,运用生物信息学方法对序列进行分析,并通过实时荧光定量PCR法研究其在龙眼体细胞胚胎（以下简称龙眼体胚）发生过程中的表达。结果表明：DL-TIR1为2328bp的mRNA全长序列（GenBank,GQ870264）,包含1个长为1761bp的开放阅读框,5′非编码区为118bp,3′非编码区为449bp,推定的氨基酸序列含586个氨基酸,与其它植物TIR1具有85%～57%同源性;DL-TIR1在龙眼体胚的各阶段均有表达,整个变化趋势呈近似＂W＂状,在子叶形胚中的表达量最高。DL-ABP1为869bp的mRNA全长序列（GenBank,GQ900592）,包含1个长为567bp的开放阅读框,5′非编码区为43bp,3′非编码区为259bp;推定的氨基酸序列含188个氨基酸,与其它植物ABP1具有87%～72%同源性,DL-ABP1在龙眼体胚中整个表达变化趋势也呈现近似＂W＂状。生长素受体DL-TIR1和＂可能的＂生长素受体DL-ABP1在龙眼体胚中的变化趋势极为相似。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	苏明华		51	398	12.0	16.0