荣昌猪SLA-DQB基因β1结构域突变分析及蛋白质序列模式预测

• 作者: 刘文 孙艳 王金勇 王鹏 白小青 黄微
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 荣昌猪 SLA-DQB 突变分析 蛋白质序列模式预测
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1306-1309
• 分类号: S828|S813.3
• 字数: 3190字
• 语种: 中文

摘要

为了深入了解荣昌猪SLA DQB基因β1结构域的变异及蛋白质序列模式分布情况,对53头荣昌猪SLADQB基因的β1结构域进行了克隆测序和序列多重比对,并在线预测蛋白质序列模式.结果发现,222 bp区域内存在9个单核苷酸的插入位点、16个单核苷酸的缺失位点和89个SNPs位点.74个氨基酸中仅由SNP位点导致的氨基酸变异位点共37个,其中有24个位点氨基酸的类型发生变化.对50条SLA- DQB基因β1结构域蛋白质序列分析发现7种类型共174个蛋白质序列模式位点.单条序列中蛋白质序列模式位点最多的12个,最少的2个.蛋白质序列模式突变位点主要发生在第9、26、45、53、61个氨基酸上,涉及到5种类型蛋白质序列模式位点的改变.结果提示,荣昌猪5L A- DQB基因β1结构域存在丰富的遗传变异和多样化的蛋白质序列模式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄微		18	114	6.0	10.0
2	王金勇		60	362	10.0	16.0
3	白小青		18	77	5.0	8.0
4	刘文		16	56	4.0	7.0
5	王鹏		1	3	1.0	1.0
6	孙艳		1	3	1.0	1.0