SLA-DQB和DRB的生物信息学分析

• 作者: 刘红林 周波 王林云 黄瑞华
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: SLA-DQB SLA-DRB SNP Bioinformatics Prostie motif
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 52-54
• 页数: 3页
• 分类号: Q1
• 字数: 2794字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.02.002

摘要

对Genbank中猪的白细胞抗原(SLA)Ⅱ类抗原基因DQB及DRB序列进行了SNP及氨基酸序列多态性分析,并对SLA-DQB及DRB分子进行了蛋白质序列模式分析(Prostie motif search).结果表明:β1功能区存在较大的变异,特别是位于抗原肽结合槽的氨基酸位点中,其变异程度更大.SLA-DQB及DRB蛋白质序列中,主要存在8种类型的蛋白质序列模式位点,其中3种类型的磷酸化位点存在蛋白模序的改变,都位于β1功能区(前94个氨基酸),且多数位点突变频率较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘红林	南京农业大学动物科技学院	116	1257	21.0	30.0
2	王林云	南京农业大学动物科技学院	129	1197	18.0	30.0
3	黄瑞华	南京农业大学动物科技学院	72	624	13.0	23.0
4	周波	南京农业大学动物科技学院	46	834	16.0	28.0