应用生物信息学分析大米过敏原RAG1的B细胞表位

• 作者: 何颖 李燕芳 邹泽红
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大米过敏原 RAG1 二级结构 B细胞表住
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 3243-3244,3250
• 分类号: S501
• 字数: 2169字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2012.06.011

摘要

[目的]预测大米主要过敏原RAG1的二级结构及B细胞表位.[方法]从Expasy蛋白质数据库中获得编码大米过敏原RAG1的氨基酸序列并以此氨基酸序列为基础,通过DNAStar Protean软件,采用Gamier-Robson方案、Chou-Fasman方案和Karplus-Schulz方案预测RAG1的二级结构,用Kyte-Doolittle亲水性方案、Emini表面可及性方案、Jameson-Wolf抗原性指数方案综合预测RAG1的B细胞表位.[结果]对大米过敏原RAG1的二级结构和B细胞表住预测的结果表明,第33 ～44、119 ～129、155～163区段可能是B细胞的优势表位.[结论]该研究综合应用多方法多参数预测大米过敏原RAG1潜在的B细胞优势表位,为RAG1 B细胞表位的进一步鉴定及其抗原性改造、表位疫苗设计等研究提供了理论依据.