欧洲女贞花粉主要过敏原Ligv1理化性质与结构的生物信息学分析

• 作者: 何颖 曹淑芬 李文 李林梅 艾云灿 邹泽红
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 欧洲女贞 过敏原 生物信息学软件 Lig v 1 抗原表位
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 中医中药与免疫
• 页码范围: 1291-1294,1298
• 页数: 5页
• 分类号: R392.8
• 字数: 4176字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-484X.2016.09.010

摘要

目的：运用生物信息学相关软件，预测欧洲女贞花粉主要过敏原Ligv1的理化性质和结构，为Ligv1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法：查询文献获得Ligv1的氨基酸序列，运用生物信息学软件分析其理化性质（ProtParam）、信号肽（SignalP 4.1 Server）、跨膜区（TMHMM Server v.2.0）、二级结构（GOR4）、MHCⅡ类抗原表位（NetMHCⅡ2.2 Server）、B 细胞抗原表位（ProteanTM 5.01）以及系统发生树（MEGA 6）。结果：Ligv1在大肠杆菌中稳定性较好，不存在信号肽与跨膜区；二级结构中无规则卷曲占大多数；Ligv1潜在MHCⅡ类抗原表位为30～44区域；B 细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列，也具有不连续的氨基酸序列；Ligv1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论：大肠杆菌是适合重组Ligv1的表达系统，Ligv1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。