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摘要:
目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Ligv1的理化性质和结构,为Ligv1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Ligv1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(ProtParam)、信号肽(SignalP 4.1 Server)、跨膜区(TMHMM Server v.2.0)、二级结构(GOR4)、MHCⅡ类抗原表位(NetMHCⅡ2.2 Server)、B 细胞抗原表位(ProteanTM 5.01)以及系统发生树(MEGA 6)。结果:Ligv1在大肠杆菌中稳定性较好,不存在信号肽与跨膜区;二级结构中无规则卷曲占大多数;Ligv1潜在MHCⅡ类抗原表位为30~44区域;B 细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列,也具有不连续的氨基酸序列;Ligv1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论:大肠杆菌是适合重组Ligv1的表达系统,Ligv1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。
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文献信息
篇名 欧洲女贞花粉主要过敏原Ligv1理化性质与结构的生物信息学分析
来源期刊 中国免疫学杂志 学科 医学
关键词 欧洲女贞 过敏原 生物信息学软件 Lig v 1 抗原表位
年,卷(期) 2016,(9) 所属期刊栏目 中医中药与免疫
研究方向 页码范围 1291-1294,1298
页数 5页 分类号 R392.8
字数 4176字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-484X.2016.09.010
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研究主题发展历程
节点文献
欧洲女贞
过敏原
生物信息学软件
Lig v 1
抗原表位
研究起点
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中国免疫学杂志
月刊
1000-484X
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大16开
长春市建政路971号
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1985
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