花生白藜芦醇合酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 李小明 林俊芳 袁致浩 谭铭琛 郭丽琼 黄秀琴
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 白藜芦醇合酶 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 69-74
• 分类号: S565.2
• 字数: 3856字
• 语种: 中文

摘要

利用Protparam、iPSORT prediction、ProtScale、SOPMA、Swiss-Modeling和Scan Prosite等生物信息学工具分别对其理化性质、信号肽、疏水性、亲水性、二级结构和三级结构进行分析.以花生粤油45总DNA和总RNA为模板,采用PCR和RTPCR技术克隆花生白藜芦醇合酶基因的DNA和cDNA序列,并利用SWISS-PROT、DNAMAN等生物信息学工具对其基因和蛋白质序列进行了分析.测序结果显示,该基因的DNA和cDNA序列长度分别为1498bp和1 251 bp,cDNA序列具有完整的开放性阅读框,编码389个氨基酸的多肽.该白藜芦醇合酶氨基酸368-378位点上存在芪合酶家族的特征位点GVLFGFGPGLT.同源性分析表明,其碱基序列与已报道的花生白藜芦醇合酶基因的一致性为99％,其氨基酸序列与已报道的花生白藜芦醇合酶氨基酸序列的一致性为100％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林俊芳	华南农业大学食品学院	95	904	18.0	26.0
5	郭丽琼	华南农业大学食品学院	94	847	17.0	26.0
9	李小明	华南农业大学食品学院	2	4	2.0	2.0
13	黄秀琴	华南农业大学食品学院	3	11	2.0	3.0
17	袁致浩	华南农业大学食品学院	1	2	1.0	1.0
18	谭铭琛	华南农业大学食品学院	1	2	1.0	1.0