牦牛基因组串联重复序列（AC）n/（GT）n的分离

• 作者: 岳碧松 张修月 泽让东科 蔡欣 贾小东
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 简单串联重复 磁珠分离
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 页码范围: 1289-1294
• 分类号: S813.3|Q78
• 语种: 中文

摘要

采用Dynal磁珠-生物素标记的（AC）12探针和牦牛基因组MboⅠ酶切片段杂交,富集牦牛基因组（AC）n/（GT）n串联重复序列并构建基因文库,阳性克隆率达到61.1%。通过对176个阳性克隆的测序获得含有（AC）n/（GT）n重复的序列92条,其中连续型重复序列40条（占43.48%）,间断型41条（占44.57%）,复合型11条（占11.96%）。从92条序列中又筛选出重复次数大于10次的（AC）n/（GT）n序列59条。相对连续型重复序列,牦牛基因组中间断型重复序列所占比率并没有显著上升,可以推测牦牛自身基因组DNA损伤修复能力的适应性进化水平较高,足以承受高海拔地区强紫外线导致的基因组核苷酸替换突变等自然选择压力。本研究从牦牛基因组分离的全新（AC）n/（GT）n重复序列将在牦牛品种/类群内遗传结构分析、品种/类群之间遗传关系研究以及牦牛个体/群体生产或适应性性状的分子标记研究等方面具有重要应用价值。