应用序列特征分析基因剪接信号

• 作者: 汪洋 马猛
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 序列特征 基因剪接 剪接位点 剪接调控元件
• 年，卷（期）: 2012,（27）
• 所属期刊栏目: 图形、图像、模式识别
• 页码范围: 180-185
• 分类号: TP391
• 字数: 4782字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2012.27.038

摘要

在基因选择性剪接调控过程中,有各种剪接信号参与其中,如剪接位点、剪接调控元件等.如何识别这些剪接信号、研究其在基因组中的分布规律是一个有趣的问题.设计了一个基于序列特征的剪接信号打分算法,该算法可赋予每个信号一个分值,表示其信号强度.基于该打分算法所构建的分类器可用于预测识别新的剪接信号.应用该打分算法研究剪接位点和剪接调控元件在基因组中的分布,发现这两类信号具有互补特性.该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马猛	安徽大学计算机科学技术学院	15	44	4.0	6.0