基因短序列模式分析及其在5'剪接位点识别中的应用

• 作者: 晏春 杜耀华 王正志
• 来源期刊: 国防科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 5'剪接位点识别 模式分析 最大熵模型
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 电子工程·计算机工程
• 页码范围: 51-56
• 页数: 6页
• 分类号: Q52
• 字数: 4051字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-2486.2006.01.012

摘要

短序列模式分析是基因序列分析的一个重要组成部分,在进行生物信号识别的时候,一般都会利用到短序列模式的信息.通常短序列模式的数目很多,如果每个都应用到生物信号识别中,会产生大量的参数,而且无法体现信号的主要特征.为了找出在识别信号位点中起关键作用的短序列模式,以信息增益作为评价依据,按照逐步选择的策略,将模式进行排队.根据排队结果,选取信息增益突出的短序列模式作为识别生物信号的关键依据,这样可以用较少的模式得到较好的结果.结合选取的短序列模式,用最大熵模型作为信号序列真实分布的估计,从而对给定序列进行识别.最后将这个方法用于5'剪接位点的识别,得到了满意的结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正志	国防科技大学机电工程与自动化学院	85	629	13.0	20.0
2	杜耀华	国防科技大学机电工程与自动化学院	19	110	7.0	10.0
3	晏春	国防科技大学机电工程与自动化学院	6	37	3.0	6.0