基于特征挖掘与融合的剪接位点识别

• 作者: 周艳红 杨雷 王卉
• 来源期刊: 华中科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 剪接位点 对数线性模型 C+G含量 权重阵列模型
• 年，卷（期）: 2006,（12）
• 页码范围: 117-120
• 页数: 4页
• 分类号: Q756
• 字数: 3210字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-4512.2006.12.038

摘要

在基于保守序列这一信号特征识别剪接位点的基础上,挖掘了可用于剪接位点识别的其他多个特征(包括剪接位点上、下游序列的碱基组成,剪接位点信号和上、下游序列的碱基组成随位点邻近序列C+G含量的变化等统计特征),建立了描述这些特征的模型,设计了能有效融合这些特征对剪接位点进行识别的对数线性模型,开发了剪接位点识别程序SpliceKey.测试结果表明:SpliceKey识别剪接位点的精度不仅较WAM方法有显著的提高,而且也优于国际上最新发布的剪接位点识别软件DGSplice.SpliceKey已提供网络服务: http:∥infosci.hust.edu.cn/SpliceKey/.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周艳红	华中科技大学生命科学与技术学院	26	243	9.0	15.0
2	王卉	华中科技大学生命科学与技术学院	22	125	7.0	11.0
3	杨雷	华中科技大学生命科学与技术学院	4	26	3.0	4.0