众核架构下Smith-Waterman算法的并行性研究

• 作者: 付铜 倪颖杰 李祖华
• 来源期刊: 高性能计算技术
• 学科: 工学
• 关键词: 序列比对 相似性 众核
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 高性能计算热点技术
• 页码范围: 41-46
• 页数: 6页
• 分类号: TP312
• 语种: 中文

摘要

本文首先介绍了Smith-Waterman算法的特点,分析了该算法的并行性,并以CUDASW++为例分析了算法对众核系统的适用性,最后进行了SW算法在Godson T系统结构上的并行性分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付铜		4	0	0.0	0.0
2	倪颖杰		11	19	1.0	4.0
3	李祖华		8	6	1.0	2.0