LoG矩阵分解的肿瘤基因特征提取方法

• 作者: 王年 许鸿洋
• 来源期刊: 安徽大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: LoG矩阵 NMF 矩阵分解 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 电子信息技术
• 页码范围: 67-72
• 页数: 6页
• 分类号: TP18
• 字数: 4236字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2162.2013.01.013

摘要

伴随着基因芯片的发展,通过研究海量的基因表达谱数据来识别肿瘤已成为生物信息学研究的热点.提出一种基于LoG(Laplace of Gaussian)矩阵分解的肿瘤基因特征提取方法,该方法首先将样本数据映射为高维空间中的点,然后构建点与点之间的LoG矩阵,在保留样本分类信息的情况下,使得无结构信息的基因表达谱数据变成具有结构信息的图,再对LoG权值矩阵进行非负矩阵分解得到能够表征样本特征的特征分量,最后用KNN对样本进行分类.通过对白血病和结肠癌基因表达谱数据的特征提取,验证该文方法的可行性和有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王年	安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室	93	1089	17.0	29.0
2	许鸿洋	安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室	2	1	1.0	1.0