鸡NLRC5基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 常国斌 张颖 徐琪 戴爱琴 朱金金 陈国宏 陈福斌 陈蓉 马腾
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 基因克隆 NLRC5基因 RACE 生物信息学 狼山鸡
• 年，卷（期）: 2013,（13）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 23-27
• 页数: 5页
• 分类号: S831.2
• 字数: 4327字
• 语种: 中文

摘要

本实验克隆了狼山鸡NLRC5基因CDS及UTR序列,对NLRC5核酸序列以及氨基酸序列特征进行分析,为进一步研究NLRC5在天然免疫系统中的功能奠定基础.采用RT-PCR方法扩增NLRC5的CDS,并通过RACE法扩增3' UTR和5'UTR,拼接成全长转录本,提交至GenBank,获得登录号:JQ044414.结果表明:鸡NLRC5基因序列与哺乳动物同源性较低,转录本全长7047nt,5'UTR 308 bp、3'UTR 1137 bp.基因定位在11号染色体,共49个外显子,转录本可能存在可变剪切体;基因上游2 kb包含C-Rel,AP-1等天然免疫信号通路重要转录因子结合位点和启动子元件;以及1个944 bp的CpG岛;其氨基酸序列包含与哺乳动物相似的NACHT及LRRs结构域,在靠近N端处包含NLS和NES,不包括其他类型信号肽,其蛋白可在胞质与核之间穿梭.表明鸡NLRC5的表达可能受到表现遗传的调控,在天然免疫及适应性免疫中的作用与哺乳动物相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐琪	扬州大学动物科技学院	178	1010	15.0	26.0
2	常国斌	扬州大学动物科技学院	91	418	11.0	16.0
3	张颖	扬州大学动物科技学院	26	104	6.0	8.0
4	陈蓉	扬州大学动物科技学院	16	105	6.0	9.0
5	戴爱琴	扬州大学动物科技学院	3	20	3.0	3.0
6	马腾	扬州大学动物科技学院	6	22	3.0	4.0