诺如病毒深圳株SZ2010422全基因组序列测定及分析

• 作者: 何雅青 封少龙 张海龙 张翠红 李慧莹 段招军 覃家剑 陈克娜 靳森
• 来源期刊: 中华实验和临床病毒学杂志
• 关键词: 诺如病毒 基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 181-183
• 页数: 3页
• 字数: 1582字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2013.03.007

摘要

目的 分析GⅡ-4型诺如病毒深圳分离株SZ2010422全基因组序列,了解其分子结构特点及进化特性.方法 根据New Orleans参考株全序列设计引物,用RT-PCR分段扩增诺如病毒全基因组,经分子克隆、测序后进行系统进化分析及衣壳区氨基酸位点分析.结果 GⅡ-4型诺如病毒深圳SZ2010422株病毒基因组全长7559 bp,病毒基因组分三个开放阅读框(ORFs),ORF1、ORF2及ORF3长度分别为5100 bp、1623 bp和807 bp,ORF1与ORF2之间有19个核苷酸重叠.深圳株SZ2010422基因组核苷酸序列与参考株GⅡ-4型New Orleans变异株同源性最高,全长同源性为99.3％,ORFI、ORF2、ORF3同源性分别为99.5％、99.2％和98.6％.根据系统进化分析,深圳SZ2010422株属于GⅡ-4 New Orleans变异株.通过对衣壳区氨基酸比对,New Orleans变异株位点变化情况为:aa310N或K→S,aa341D→N,aa359T→S,aa396H→P,aa460H→Y.结论 诺如病毒深圳株SZ2010422属于GⅡ-4型New Orleans变异株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段招军	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所	114	687	15.0	20.0
2	封少龙	南华大学公共卫生学院	23	67	5.0	6.0
3	何雅青		53	626	13.0	23.0
4	张海龙		42	304	9.0	16.0
5	张翠红	南华大学公共卫生学院	3	9	2.0	3.0
6	覃家剑	广西桂林医学院生物技术学院	1	0	0.0	0.0
7	李慧莹	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所	12	32	5.0	5.0
8	靳森	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所	3	2	1.0	1.0
9	陈克娜		2	0	0.0	0.0