蛋白质相互作用热点残基的预测

• 作者: 张少辉 张晓龙
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质相互作用 蛋白质热点残基 支持向量机
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 151-157
• 页数: 7页
• 分类号: Q816
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2013.20157

摘要

氨基酸突变扫描实验揭示了在蛋白质相互作用的结合过程中大部分的结合自由能是由极少数热点残基贡献的,通常定义结合自由能变化△△G≥2.0 kcal/mol的蛋白质残基为热点残基.热点残基对蛋白质相互作用具有重要意义.因此,如何有效进行热点残基的预测,仍然是一个研究课题.综合蛋白质氨基酸理化属性的加权疏水性、加权残基接触数、结构属性溶剂可接近面积和残基突出指数等特征,提出利用机器学习支持向量机算法来预测热点残基的方法.所提方法在丙氨酸热力学数据库数据和结合界面数据库选定的数据集上有很好的效果.在一定程度上对以后的研究发展有所帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓龙		49	652	13.0	24.0
2	张少辉		1	0	0.0	0.0