(木奈)褐变果实均一化全长cDNA文库的构建及部分ESTs序列分析

• 作者: 姜翠翠 潘东明 赖燕 郑鸿昌 陈桂信
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: (木奈) 褐变 均一化全长cDNA文库 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 292-296
• 页数: 5页
• 分类号: S436.6
• 字数: 3644字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.02.017

摘要

以发生褐变初期的(木奈)果肉总RNA为材料,对SMARTTM cDNA合成方法进行改良,并将长距离PCR、DSN处理和定向克隆相结合,成功构建(木奈)褐变果实均一化全长cDNA文库.经检测,该文库的初始滴度为2.0×106 pfu/mL,重组率为99％,插入片段大小平均为1.8 kb,文库质量良好.随机挑取720个阳性克隆进行5'EST测序,共获得684条有效的ESTs序列；并将684条有效序列拼接后,58条被组装成21个重叠群(contigs),单拷贝(singlets)基因有626条,共得到647个单基因簇(unigenes),文库冗余率为8.4％.用Blast 2 go在线软件对测序结果进行功能注释和归类分析,结果显示,已知功能基因与能量代谢、蛋白质合成与降解、次生代谢物质、细胞壁代谢和转录因子有关.该文库的构建有利于从分子水平上研究(木奈)果实褐变发生的机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖燕	福建农林大学生命科学学院	16	60	5.0	7.0
2	潘东明	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	201	1594	19.0	27.0
3	陈桂信	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	59	447	13.0	18.0
4	姜翠翠	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	51	220	8.0	12.0
8	郑鸿昌	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	3	15	3.0	3.0