麻疯树全植株全长均一化cDNA文库构建及EST序列分析

• 作者: 徐莺 朱勋路 陈放 高继海
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 麻疯树 均一化全长cDNA文库 表达序列标签 库容
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 935-942
• 分类号: Q78
• 字数: 5012字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2011.04.039

摘要

以麻疯树根、茎、叶、花和果实为材料,使用DSN (duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanism at 5' end of RNA transcript)建库技术相结合,构建了麻疯树全植株均一化全长cDNA文库.经检测库容为1.4×106个克隆,插入片段平均长度大于1 kb.随机挑取200个克隆,利用PCR方法测得文库重组率达95％,48.95％的EST(Expressed Sequence Tag)没有同源性,显示了这些ESTs中能够发现新功能基因的可能性.与GeneBank Nr数据库中已知功能基因有较高同源性的有97条ESTs,相关同源性的已知基因分别参与基础代谢与运输、细胞构成、能量转换、辅酶代谢与运输、信号传导、翻译机翻译后的修饰折叠等过程.这是第一次以麻疯树全植株为材料构建全长均一化cDNA文库.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈放	四川大学生命科学学院	310	4897	34.0	55.0
2	徐莺	四川大学生命科学学院	103	1016	18.0	27.0
3	高继海	四川大学生命科学学院	8	40	4.0	6.0
4	朱勋路	四川大学生命科学学院	5	11	1.0	3.0