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摘要:
目的 对分离自新疆散发戊型肝炎(戊肝)患者的1株戊型肝炎病毒(HEV) W2-1全基因组序列进行测定和分析.方法 应用RT-PCR分段扩增的方法获得W2-1的全长基因组序列;通过与GenBank中HEV代表株相比较,对其进行分型和基因同源性分析.结果 W2-1全长7212 nt,5'和3'UTR以及3个开放读码框(ORF1~3)分别为27、28、5079、1980和345 nt.序列分析表明,W2-1属于基因1型1b亚型,与引起1986-1989年新疆戊肝流行的HEV序列同源性为97.2%~ 98.5%,与2000-2008年我国分离到的1b亚型HEV同源性为97.6%~ 99.2%;其ORF1 ~3蛋白序列中含有区别于3型和4型HEV的特异性氨基酸位点.结论 W2-1属于1b亚型,新疆戊肝大流行之后1b亚型在我国人群中仍有传播,并且其基因序列稳定.
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文献信息
篇名 1株基因1型戊型肝炎病毒全基因组序列的测定及分析
来源期刊 中华微生物学和免疫学杂志 学科
关键词 戊型肝炎病毒 全基因组 序列分析 基因型
年,卷(期) 2013,(6) 所属期刊栏目 病毒学
研究方向 页码范围 429-433
页数 5页 分类号
字数 4579字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2013.06.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 马红霞 17 76 5.0 8.0
2 耿彦生 河北大学病原生物学系 19 41 3.0 6.0
3 王佑春 34 44 4.0 4.0
4 黄维金 18 22 3.0 3.0
5 赵晨燕 7 9 2.0 3.0
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戊型肝炎病毒
全基因组
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基因型
研究起点
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相关学者/机构
期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
月刊
0254-5101
11-2309/R
大16开
北京市经济技术开发区经海二路38号
2-55
1981
chi
出版文献量(篇)
5865
总下载数(次)
10
总被引数(次)
26456
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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