茶树硒代半胱氨酸甲基转移酶基因生物信息学分析

• 作者: 刘声传 鄢东海 魏杰
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 CsSMT基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 2221-2226
• 页数: 6页
• 分类号: S571.1
• 字数: 3649字
• 语种: 中文

摘要

为揭示茶树(Camellia sinensis)硒代半胱氨酸甲基转移酶(Selenocysteine methyltransferase,SMT)基因CsSMT的生物学功能及其分子调控机理,利用生物基因组学数据库和生物信息学分析软件,对CsSMT进行生物信息学分析,预测该基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建CsSMT同源基因的系统进化树.结果表明:CsSMT基因cDNA全长1368 bp,开放阅读框位于50～l105 bp处.编码产物为稳定的亲水性蛋白,分子式为C11670 H2645 N459 O532 S15,无跨膜结构,无信号肽,定位于细胞质基质.二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维建模成功.系统进化分析表明,CsSMT基因mRNA与拟南芥同型半胱氨酸S-甲基转移酶基因(Homocysteine S-methyltransferase,HMT)聚为一组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘声传		21	151	8.0	12.0
2	魏杰		15	111	6.0	10.0
3	鄢东海		12	84	5.0	9.0