烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶生物信息学分析

• 作者: 徐成龙 户艳霞 杨彦明 王德勋 田熙 苏家恩 薛波
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 咖啡酸3-O-甲基转移酶 生物信息
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生理与生物技术
• 页码范围: 5-8
• 页数: 4页
• 分类号: S572
• 字数: 1669字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2019.05.002

摘要

烟草的抗性与其组织的木质素含量具有一定的关系,而咖啡酸3-O-甲基转移酶影响木质素的合成.为清楚地认识烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶,本研究采用Interpro、NetPhos和TNT工具对烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶成员的结构域、磷酸化位点和进化树进行分析.结果 表明,烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶具有相同的植物甲基转移酶二聚化结构域和O-甲基转移酶结构域,前者位于烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶序列的第33～85位之间,后者位于序列的第128～358位之间;NtCOMT1和NtCOMT2的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸数目较为相似,而NtCOMT3的磷酸化位点数目明显大于NtCOMT1和NtCOMT2的数目,且三者均以酪氨酸数目最少;NtCOMT3属于进化树的第一类,而NtCOMT1和NtCOMT2属于进化树的第二类,烟草与马铃薯的咖啡酸3-O-甲基转移酶进化程度较为相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏家恩		39	129	6.0	10.0
2	王德勋		38	209	8.0	13.0
3	户艳霞		27	73	5.0	7.0