矮牵牛Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆与分析

• 作者: 吴志明 张蜀宁 江彪 颜志明 魏跃
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 矮牵牛 Ty1-copia逆转座子 异质性 同源性
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺·农业工程·食品加工
• 页码范围: 1627-1632
• 页数: 6页
• 分类号: S681.6
• 字数: 3065字
• 语种: 中文

摘要

采用植物Ty1-copia类逆转点子逆转录酶的保守区设计简并引物,经PCR扩增从矮牵牛(Petunia hybrida Vilm.)中扩增出260bp左右的目标条带,扩增产物经测序及序列分析,总共获得了24条逆转录酶序列.结果表明,24条逆转录酶序列长度变化范围为260～272 bp,同源性范围为49.8％～97％,经核苷酸聚类分析分为7个家族.Ty1-copia类逆转录酶在序列长度、碱基组成上具有高度异质性,翻译成氨基酸后,有18条序列是完整的,另外6条序列出现终止密码子突变或移框突变,终止密码子突变和移框突变是矮牵牛Ty1-copia逆转座子高度异质性的重要表现.与已登陆的不同植物物种的Ty1-copia类逆转录酶序列进行同源性分析,结果与部分植物物种具有较高的同源性,可能有共同起源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张蜀宁	南京农业大学南方蔬菜遗传改良重点开放实验室	63	1039	18.0	29.0
2	颜志明		27	48	3.0	6.0
3	魏跃		15	47	5.0	6.0
4	吴志明	南京农业大学南方蔬菜遗传改良重点开放实验室	3	7	2.0	2.0
5	江彪	南京农业大学南方蔬菜遗传改良重点开放实验室	2	33	2.0	2.0