组织培养条件下苹果Ty1-copia类逆转座子的转录活性

• 作者: 孙俊 房经贵 章镇 蔡斌华 陶建敏
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 Ty1-copia类逆转座子 转录活性 组织培养
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 441-445
• 页数: 5页
• 分类号: S661.1
• 字数: 698字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-9980.2005.05.001

摘要

研究了苹果基因组中Ty1-copia类逆转座子的转录活性、多样性及其甲基化水平.在培养基MS+2,4-D 2mg/L+BA 0.2 mg/L+NAA 0.5 mg/L上诱导了1个月的愈伤组织中用RT-PCR方法检测到了270 bp的目的条带,而对照、继代组培苗和不含2,4-D的愈伤中均没有目的条带的扩增,说明一定浓度的2,4-D可以诱导苹果中Ty1-copia类逆转座子的表达活性.将目的条带回收、克隆和测序后进行分析:所克隆的21条序列虽都为Ty1-copia类逆转座子逆转录酶保守序列,但存在很大的异质性,21个克隆的核甘酸序列变化范围为196-290 bp;翻译成氨基酸后存在缺失、插入、移框和终止密码子突变,7个克隆在氨基酸保守序列‘SLYGLKQ'处有1-2氨基酸位点的突变,说明这些序列对应的逆转录酶多数可能已失去了其原有功能.将21条序列进行聚类分析,除ART20外,其它克隆可聚为3类,并分别与GenBank上某些物种的相应序列同源性很高,表明在不同物种间可能存在逆转座子的横向传递作用.甲基化试验表明苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子甲基化水平高.这些都表明Ty1-copia类逆转座子对苹果基因型的多样性及基因组的进化具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章镇	南京农业大学园艺学院	286	5756	35.0	58.0
2	孙俊	南京农业大学园艺学院	10	85	6.0	9.0
6	陶建敏	南京农业大学园艺学院	118	1564	23.0	30.0
7	房经贵	南京农业大学园艺学院	194	3087	29.0	47.0
8	蔡斌华	南京农业大学园艺学院	39	571	15.0	22.0