苹果Ty1-copia类逆转座子LTR10序列及其在苹果属植物中的遗传多样性分析

• 作者: 孙俊 孙其宝 房经贵 王昆 王飞 章镇
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 Ty1-copia类逆转座子LTRs 调控元件 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 43-48
• 分类号: S661.1
• 字数: 4276字
• 语种: 中文

摘要

应用改良的Pearce方法分离苹果Tyl-copia类逆转座子RNaseH-LTRs,分离到的RNaseH-LTR10序列已在GenBank注册(登录号DQ534515),该序列长度为299 bp.分析结果表明其5'端为含有终止密码子的RNaseH基因,PPT(polypurine tract)之后是3'-LTR,PPT起始于终止密码子内10 bp处,3'-LTR的起始标志末端倒转重复序列(inverted repeat,IR)TG紧随其后.LTR10的正链和反链均含有多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box,α-淀粉酶启动子的保守序列及受不同胁迫条件作用的调控元件,如AuxRE、ABRE、HSE等.利用S-SAP技术研究了LTR10逆转座子在苹果属8个野生种和22个栽培品种中的遗传多样性,多态性片段比例为86.5%;品种长祝较祝光少1条约400 bp的特异性扩增条带.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章镇	南京农业大学园艺学院	286	5756	35.0	58.0
2	孙俊	南京农业大学园艺学院	10	85	6.0	9.0
6	孙其宝	安徽省农业科学院园艺研究所	91	573	13.0	19.0
7	王飞	南京农业大学园艺学院	16	88	6.0	9.0
8	房经贵	南京农业大学园艺学院	194	3087	29.0	47.0