菊花翻译起始因子4E基因的克隆、表达分析及其互作蛋白的筛选

• 作者: 安娟 宋爱萍 房伟民 楼望淮 管志勇 蒋甲福 陈发棣 陈素梅
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 菊花 eIF4E 病毒 表达分析 亚细胞定位 酵母双杂交系统
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1881-1891
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.09.016

摘要

[目的]为了研究翻译起始因子4E在菊花中的表达特性及功能,克隆菊花翻译起始因子4E(CmeIF4E)基因,分析其表达特性并初步筛选得到菊花CmeIF4E的互作蛋白.[方法]根据已报道植物的eIF4E序列设计引物,采用RT-PCR和RACE技术克隆菊花eIF4E基因,荧光定量PCR及亚细胞定位分析菊花CmeIF4E的表达特性,并用酵母双杂交系统筛选其互作蛋白.[结果]克隆获得菊花eIF4E基因全长914 bp,其开放阅读框(0RF) 654 bp,编码1条包含218个氨基酸残基的多肽,将该基因名为CmeIF4E,GenBank登录号为JQ904591.氨基酸序列比对和系统进化分析表明,菊花CmeIF4E与已报道的莴苣的同源基因亲缘关系最近,该结果与植物分类学相符.荧光定量PCR分析结果显示,CmeIF4E基因在切花菊‘神马'各个器官中均有表达,幼嫩的根中表达量最高,其次是叶片,而茎中表达量最低.亚细胞定位分析发现,CmeIF4E在细胞的核、质、膜上都有表达.筛选得到菊花CmeIF4E互作蛋白,其中包括蛋白翻译和翻译后修饰、光合作用、抗逆和防御等相关蛋白.[结论]CmeIF4E在菊花组织中为组成型表达,亚细胞定位显示其在细胞核、细胞质、细胞膜上都有表达.候选蛋白分析验证了CmeIF4E在翻译起始中的作用,还推测其可能与光合系统、植物的抗逆防御相关,结果为进一步研究该蛋白在菊花中的作用提供了重要依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	房伟民	南京农业大学园艺学院	167	2449	27.0	37.0
2	陈发棣	南京农业大学园艺学院	260	4491	34.0	49.0
3	陈素梅	南京农业大学园艺学院	114	1676	23.0	32.0
4	楼望淮	南京农业大学园艺学院	2	22	1.0	2.0
5	管志勇	南京农业大学园艺学院	67	707	15.0	24.0
6	蒋甲福	南京农业大学园艺学院	33	304	9.0	16.0
7	宋爱萍	南京农业大学园艺学院	6	33	3.0	5.0
8	安娟	南京农业大学园艺学院	1	1	1.0	1.0