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广东省中山市登革Ⅰ型病毒的分离鉴定及E/NS1基因序列分析
广东省中山市登革Ⅰ型病毒的分离鉴定及E/NS1基因序列分析
作者:
刘洪波
吴衍恒
师舞阳
梁洪
谢颖
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
登革病毒
E基因
NS1基因
序列同源性
系统进化
摘要:
目的 分离鉴定中山市2007年及2012年流行的登革病毒,从分子水平分析其地域来源和系统进化情况.方法 用C6/36细胞分离10份2007年登革病毒特异性IgM抗体阳性血清和4份2012年登革病毒核酸阳性血清中的病毒,采用Real time-PCR对毒株进行血清型鉴定,RT-PCR扩增毒株E/NS1基因并进行序列测定,分析其与不同区域流行株和国际标准株的同源性和系统进化情况. 结果 共分离鉴定到6株登革Ⅰ型病毒,其中2株为2007年流行株,4株为2012年流行株,分别命名为2007ZSDengue1-2和2012ZSDengue1-4.2012ZSDengue1-2与柬埔寨、越南等东南亚国家近年流行的登革Ⅰ型毒株相似性高(大于99.0%),进化距离最短(0.011~0.012).2012ZSDengue3-4,2007ZSDengue1-2与广东省珠海市2007年流行和新加坡、日本、泰国等亚洲国家近年流行的登革Ⅰ型毒株相似性高(大于99.0%),进化距离最短(0.007~0.024).中山流行株与登革Ⅰ型国际标准株、非洲和美洲流行株相似性在90.0% ~94.0%之间,进化距离较远(0.065~0.108);与登革Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型国际标准株NGC、H87、H241相似性约为68.0%、66.0%、71.0%,进化距离最远(0.369~0.505). 结论 中山市2007年及2012年流行株为登革Ⅰ型病毒,可能属于东南亚国家输入性毒株,但输入源头有所不同.
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鹅细小病毒
NS1基因
克隆
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篇名
广东省中山市登革Ⅰ型病毒的分离鉴定及E/NS1基因序列分析
来源期刊
实用预防医学
学科
医学
关键词
登革病毒
E基因
NS1基因
序列同源性
系统进化
年,卷(期)
2013,(8)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
932-936
页数
5页
分类号
R512.8
字数
3490字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1006-3110.2013.08.012
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研究去脉
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实用预防医学
主办单位:
中华预防医学会
湖南省预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1006-3110
CN:
43-1223/R
开本:
大16开
出版地:
长沙市芙蓉中路一段450号
邮发代号:
42-192
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
13616
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21
总被引数(次)
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