旱稻孢囊线虫在广西的发生及其rDNA-ITS异质性分析

• 作者: 刘志明 卓侃 宋汉达 廖金铃 张洪玲 王宏洪 陆秀红 陶冶 黄金玲
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 旱稻孢囊线虫 水稻 鉴定 rDNA-ITS 异质性
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 78-84
• 页数: 7页
• 分类号: Q755|S432..111..4+8
• 字数: 5618字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2014.01.011

摘要

2011年，从广西龙胜梯田的水稻根系和稻田土壤中分离到一种孢囊线虫.该线虫形态特征与已报道的旱稻孢囊线虫(Heterodera elachista)相符，其 rDNA-ITS序列与 GenBank中旱稻孢囊线虫的 rDNA-ITS序列相似性为97．7％~99．3％. rDNA-ITS分子发育树表明该线虫与旱稻孢囊线虫以100％的置信度及较小的遗传距离形成一个单系，据此将该线虫鉴定为旱稻孢囊线虫.进一步对本研究获得的10条旱稻孢囊线虫 rDNA-ITS区序列及 Tanha Maafi 等报道的1条旱稻孢囊线虫 rDNA-ITS序列(AF498391)的酶切位点进行分析，结果发现AluⅠ、AvaⅠ、MvaⅠ和RsaⅠ4个内切酶的酶切位点在11条序列中完全一致，而Bsh1236Ⅰ、BsuRⅠ和CfoⅠ3种酶的酶切位点存在变异，其中Bsh1236Ⅰ和BsuRⅠ有2种变异型， CfoⅠ则有3种变异型，表明旱稻孢囊线虫的 rDNA-ITS序列存在DNA异质性.