蒺藜苜蓿全基因组中WRKY转录因子的鉴定与分析

• 作者: 南志标 宋辉
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: WRKY 蒺藜苜蓿 基因重复 系统进化 EST表达模式
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 152-168
• 页数: 17页
• 字数: 8265字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2014.0152

摘要

WRKY基因家族是植物基因组内一类重要的转录因子,参与植物许多生理生化过程,如植物发育、代谢以及生物和非生物胁迫.目前,已在多种植物中鉴定出WRKY基因家族,但是关于蒺藜苜蓿(Medicago truncatula L.) WRKY基因家族的系统分析鲜有报道.文章利用生物信息学方法,从蒺藜苜蓿全基因组中共鉴定出93个WRKY基因,包括81个标准的WRKY基因(19个Ⅰ型基因,49个Ⅱ型基因以及13个Ⅲ型基因)和12个非标准类型的WRKy基因.对这些WRKY基因进行了基因重复、染色体定位、基因结构、保守基序和系统进化等方面的分析.蒺藜苜蓿WRKY基因家族中最近共发生了11次基因重复事件,共涉及24个基因,占全部WRKY基因的26％.染色体物理定位分析表明,蒺藜苜蓿WRKY基因在染色体上呈不均匀分布,存在6个基因簇.对WRKYⅢ型基因的进化分析表明,它们在长期的进化过程中受纯化选择压力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	南志标	兰州大学草地农业科技学院	86	2353	25.0	46.0
2	宋辉	兰州大学草地农业科技学院	1	23	1.0	1.0